病原体可以分为："正常微生物菌群"和"条件致病微生物(条件致病病原体)"。
"病原体"是指可造成人或动物感染疾病的微生物（包括细菌、病毒、立克次氏体、寄生虫、真菌）或其他媒介(微生物重组体包括杂交体或突变体)。病原体的形态，有球形、杆状、丝状、螺旋状，还有许多复杂又精巧的结构。肌体遭病原体侵袭后是否发病，一方面自身免疫力有关，另一方面也取决于病原体致病性的强弱和侵入数量的多寡。一般地，数量愈大，发病的可能性愈大。尤其是致病性较弱的病原体，需较大的数量才有可能致病。少数微生物致病性相当强，轻量感染即可致病，如鼠疫、天花、狂犬病等。
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