事业单位被审计部门查处违反财经法规，根据审计查出问题的性质，按照不同类别进行定性处理，如有违反财政法规方面的、有违反财务收支方面的、有违反固定资产管理方面的、有违反基建建设方面的，通常按照国务院427号令《财政违法行为处罚处分条例》和审计法进行处理处罚。
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