华南农业大学最难受的就是对比过去，一个能进入全国百强的大学，在2017年却没能进入双一流大学。这就导致华南农业大学尽管历史比较悠久，再加上学校的农学特色，省内经济支持，还是没能进入双一流行列。之所以很多人想要进入双一流就是因为学校想要在知名度上提升一个档次，而且还能获得更多的国家的支持，所以现在对于没有机会进入双一流大学的学校来说，白白失去了一次提升的机会。
华南农业大学尽管现在的学校目标是发展成为一所综合性大学，但是华南农业大学的部分学科还是出一个比较“单一”的状态，因为华南农业大学的优势学科还是在农学，除了农学，几乎华南农业大学很难再有什么学科能够吸引人的。
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