卫生检验检疫专业毕业生一般就业于疾病预防控制中心、医院检验部门、出入境检验检疫局、食品药品监督管理局、农产品质量监督局、卫生局、海关、化妆品公司、水厂、，环保局、质监局、医疗器械销售、第三方检验检测公司等。
1.省、市、自治区各级疾病预防控制中心和卫生监督机构从事卫生理化检验、微生物检验和毒理学评价。
2.海关有关检验部门和省、市进出口检验检疫局从事进出口产品的理化检验和微生物检验。
3.医院的化验科和营养科从事食品的生物材料检验和生化、病毒和细菌学检验。
4.各级水务公司都从事水质的物理、化学和微生物检查。
5.各级环境监测站均从事水质、土壤和空气等环境样品的检测。
6.各食品厂、化妆品厂等企业的产品检验部门从事食品和化妆品的质量检验。
7.技术监督局和药物管制研究所正在进行检查。
卫生检疫专业是近年来兴起的一门新兴学科。一方面，这表明卫生检疫人才储备相对匮乏。另一方面，国家将重点培养和大力发展，社会需要大量卫生检疫人才。卫生检疫专业的一般目的地包括海关、动植物检验检疫局、科研院所、高校、食品卫生行业管理、企事业单位等，因此就业趋势还是比较乐观的。
就业方向：疾病控制单位：卫生检疫、临床检验、细菌检验；检验单位：卫生检验、食品检验、动植物检验；日化、医药、食品企业：产品质量检验。
研究生入学考试方向：公共卫生和预防医学、公共卫生、流行病学和卫生统计、劳动卫生和环境卫生。
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