1.清华大学北京协和医学院（北京协和医院、阜外心血管医院、肿瘤医院）
2.北京大学内科（人民医院、第一医院、第二医院、积水潭医院）
3.复旦大学上海医学院（中山医院、妇产医院、华山医院）
4.上海交通大学医学院（瑞金医院、仁济医院、新华医院、上海第六医院、上海第九医院）
5、华中科技大学同济医学院（同济医院、武汉协和医科大学医院、Liyuan医院）
6.中山大学中山医学院（中山第一医院肿瘤医院、中山第二医院、中山第三医院）
7.四川大学华西医学中心（华西医院、华西妇幼医院、华西口腔医院）
8.第二军医大学（长征医院、长海医院、东方肝胆医院）
9.第四军医大学（唐都医院、西京医院、口腔医院）
10.第三军医大学（西南医院、新桥医院、大坪医院）
11.中南大学湘雅医学院（湘雅第一医院、湘雅第二医院）
12、北京大学中医药学院（东直门医院，湖北寺中医医院）
13.浙江大学医学院（浙江省第一医院、浙江省第二医院、邵逸夫医院）
14.中国医科大学（盛京医院、中国医科大学第一医院、中国医科大学第四医院）
15.南方医科大学（南方医院、珠江医院）
16.首都医科大学（同仁医院、宣武医院、安贞医院、佑安医院）
17.哈尔滨医科大学（第一附属医院、第二附属医院、肿瘤医院）
18、广州大学中医药学院（第一附属医院和第二附属医院）
19.吉林大学白求恩内科（白求恩第一医院、白求恩第二医院、白求恩第三医院）
20.山东大学医学院（齐鲁医院、山东大学第二医院、省立医院）
21.西安交通大学医学院（第一医院、第二医院、中日友好医院）
22.重庆医科大学（第一医院、第二医院、儿童医院）
23.天津医科大学（综合医院、医科大学第二附属医院、肿瘤医院）
24.武汉大学医学院（湖北省人民医院、中南医院）
25、上海中医药大学（龙华医院曙光医院，中医医院）
26.南京大学医学院（鼓楼医院、南京军区总医院）
27.南京医科大学（一、二附属医院）
28.汕头大学医学院（第一附属医院、第二附属医院、附属肿瘤医院）
29、山东中医药大学（一、二附属医院）
30青岛大学医学院（青岛大学医疗集团）
31.河北医科大学（一、二附属医院）
32.郑州大学医学院（第一附属医院、第二附属医院）
33.苏州大学医学院（第一附属医院）
34.安徽医科大学（第一附属医院、省附属医院）
35.福建医科大学（第一附属医院、第二附属医院、协和医院）
36.广西医科大学（第一附属医院肿瘤医院）
37.温州医学院（一、二附属医院）
38、南京大学中医药学院（江苏中医医院，第二附属医院）
39.山西医科大学（一、二附属医院）
40.新疆医科大学（一、二附属医院）
41.兰州大学医学院（第一附属医院、第二附属医院）
42.大连医科大学（一、二附属医院）
43.暨南大学医学院（广州华侨医院、珠海市人民医院）
44.东南大学医学院（中大医院）
45.南昌大学医学院（第一附属医院和第二附属医院）
46.昆明医学院（第一附属医院和第二附属医院）
2016年全国医科大学排名2016年全国医科大学排名同济大学医学院47所（上海第十医院、同济医院）
48.广州医学院（第一附属医院、第二附属医院）
49.广东医学院（广东医学院附属医院）
50.新乡医学院（新乡医学院第一附属医院）
1、 北京协和医学院是中华人民共和国卫生和计划生育委员会直属的唯一一所重点医科大学。它与中国医学科学院的学院和大学合并。是中国国家医学科学学术中心和综合性科研机构。“优秀博士教育培养计划”试点高校。中国协和医科大学成立于1917，捐赠的是美国洛克菲勒基金会。1919年10月，它开办了一所八年制本科医学院。这是中国第一所拥有八年制临床医学和护理本科教育的医学院。
2、 首都医科大学成立于1960年，是北京的一所重点大学。这是一所试点大学的“优秀医生教育和培训计划”。著名泌尿外科专家、两院院士、前全国人大常委会副委员长吴阶平教授是我院第一任院长、终身名誉院长。
3、 北京大学医学系是北京大学医学系的前身，是国立北京医学院。始建于1912年10月26日，是中国政府教育部依靠自身实力开办的第一所全国性西医专科学校。1985年，学校更名为北京医科大学。2000年4月3日，原北京医科大学和北京大学正式合并组建新的北京大学。2000年5月4日，北京医科大学正式更名为北京大学医学系。
4、 四川大学华西医学院（原华西医科大学）于2000年并入四川大学。目前是四川大学华西校区。1914年，私立华西协和大学成立医学院。时代变迁后，更名为四川医学院、华西医科大学和四川大学华西医学院。目前，四川大学华西医学院已有114年的丰富经验。
5、北京大学中医药学院是中华人民共和国教育部直属的国家重点大学，具有中医学的学科特色。是国家“211工程”和“985工程优势学科创新平台”重点建设单位之一。它是“111计划”中选定的一所大学。该项目由教育部、国家卫生和计划生育委员会、国家中医药管理局和北京市联合主办。
6、第三军医大学，中国人民解放军第三军医大学，座落于中国风景秀丽的城市——中央直属重庆。是一所历史悠久、军事特色鲜明的军事医学院校。它是新中国成立后第一批国家重点大学。是军队“2110工程”重点建设院校之一。它目前是军队一级试点大学的“优秀博士教育培养计划”。
7、第二军医大学全称为“中国人民解放军第二军医大学”。它是中国人民解放军总后勤部直属的国家重点医科大学，为军队培养医学人才和卫生管理干部。是国家“211工程”重点建设院校之一，总后“2110工程”和“530工程”重点建设院校，教育部“优秀博士教育培养计划”试点大学。
8、 中国药科大学是教育部直属的具有药学特色的国家重点大学。是国家“211工程”和“985工程优势学科创新平台”重点建设高校之一。它是“111计划”和“优秀工程师教育和培训计划”中选择的大学之一。它是中国首批拥有博士学位的大学之一，是一所拥有硕士学位授予权的高等学府。
9、南方医科大学，原中国人民解放军第一军医大学，是广东省“211工程”下的省级重点大学。它直接隶属于广东省人民政府。它由广东省人民政府、国家卫生和计划生育委员会和中华人民共和国教育部共同建设。入选广东省优秀医生教育培训计划和一流园林学院。
10、 天津医科大学是天津市教委直属的重点研究型、教学型医科大学。是“211工程”重点建设院校之一。“优秀博士教育培养计划”试点学院是国家批准的第一所试行八年制的医学院。它也是首批15所试行七年制的大学之一。
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