一、岗位不同：
科员是一般本科生进入公务员系统后的级别。行政综合是招考部门给某个岗位取得名字，大概就是说这个岗位是做行政方面的综合事务，考取后，定级一般也是科员。
二、级别不同：
公务员里的行政科员和科员是级别的不同，国家公务员的级别里有明确规定的科员级别，分别是从十八级到二十六级。而行政科员比科员要高一些级别。
三、制度不同：
在公务员制度与参照公务员制度管理的党的机关工作人员的职务与级别为十八级至二十六级。科员其实就是一般工作人员，非领导干部分为八种：巡视员、副巡视员、调研员、副调研员、主任科员、副主任科员、科员、办事员。
根据2019年3月中共中央办公厅印发《公务员职务与职级并行规定》，科员分为：一级科员和二级科员。
扩展资料：
任职定级
《新录用公务员任职定级规定》
第四条考核合格的新录用公务员，按以下规定任职定级：
直接从各类学校毕业生中录用的、没有工作经历的公务员：高中和中专毕业生，任命为办事员，定为二十七级；大学专科毕业生，任命为科员，定为二十六级；
大学本科毕业生、获得双学士学位的大学本科毕业生（含学制为六年以上的大学本科毕业生）、研究生班毕业和未获得硕士学位的研究生，任命为科员，定为二十五级；获得硕士学位的研究生，任命为副主任科员，定为二十四级；获得博士学位的研究生，任命为主任科员，定为二十二级。
新录用公务员任职时间从试用期满之日起计算
温馨提示：