存量留抵退税和增量留抵退税的区别在于退税金额的界定不同，存量留抵退税通过将当期期末的留抵税额与2019年3月31日的留抵税额相比较后，对孰低者的部分实施留抵退税；而增量留抵退税通过将当期期末的留抵税额与2019年3月31日的留抵税额相比较后，根据实际情况对增量的部分或当期期末的留抵税额实施留抵退税。
其中，增量留抵退税和存量留抵退税同属于我国国家税务机关所推行的一项税收管理措施，并按照《财政部、税务总局关于进一步加大增值税期末留抵退税政策实施力度的公告》的规定实施处理。
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