科层组织结构一般是一种相对集权的组织结构。科层组织结构存在于两类管理机构中，一类是直线指挥机构，如总部、分部、车间、工段和班组等；一类是参谋职能机构，如研究开发部、人力资源部、财务部、营销部及售后服务部等。分别对应直线人员，如总经理、分部经理、车间主任、工段长和班组长等，以及参谋人员，如人力资源部部长、财务部部长、营销部部长等。
在科层组织结构中，直线人员是主体，参谋人员是辅助。企业的生产经营活动主要由直线人员统一领导和指挥，他们有权在自己的职责范围内向下级发布命令和指示，并负全面的领导责任。职能部门则设置在直线领导之下，分别从事专业管理，是各级直线领导的参谋部。职能部门所拟定的计划、方案以及有关指示等，均应由直线领导批准后下达执行，职能部门对下级领导者和下属职能部门无权直接下达命令或进行指挥，只能起到提供建议、咨询以及进行业务指导的作用。
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