海关审计是由中华人民共和国审计署以及审计署财税海关审计局等部门依据法律、法规，对海关总署、各省分署、各直属分关及下属单位的财政、财务收支及其相关的经济、管理活动的真实性及合法性以及效益和管理绩效进行审查，以加强海关管理并提高行政单位工作效率的一种监督性经济活动。
开展海关审计工作，符合全国审计系统的广泛需求，同时也贯彻落实了科学发展观，有利于完善海关的依法行政工作以及政府的法治建设工作，有助于建立全方位的监督制约机制。
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