期初余额的审计包括注册会计师首次接受委托对被审计单位的财务报表进行审计时所涉及的如何审计财务报表期初余额问题，以及注册会计师执行连续审计业务时所涉及的如何审计财务报表期初余额问题。
注册会计师在执行首次审计业务时，针对期初余额的目标在于获取充分、适当的审计证据以确定期初余额是否含有对本期财务报表产生重大影响的错报，以及确定期初余额反映的恰当的会计政策是否在本期财务报表中得到一贯运用，或会计政策的变更是否已按照适用的财务报告编制基础作出恰当的会处理和充分的列报与披露。
注册会计师在当期审计中，通常只需关注被审计单位经审计的上期期末余额是否已正确结转至本期，或在适当的情况下已作出重新表述，很少再实施其他专门的审计程序。
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